Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms