Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pax8Q00288 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pax8Q00288 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms