Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms