Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrig1P70193 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrig1P70193 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms