Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Traf5P70191 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf5P70191 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms