Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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UbdP63072 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
UbdP63072 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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UbdP63072 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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UbdP63072 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbdP63072 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbdP63072 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbdP63072 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbdP63072 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbdP63072 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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UbdP63072 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
UbdP63072 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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UbdP63072 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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UbdP63072 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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UbdP63072 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbdP63072 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbdP63072 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbdP63072 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbdP63072 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbdP63072 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbdP63072 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbdP63072 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbdP63072 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms