Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pfn1P62962 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pfn1P62962 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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