Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab3cP62823 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms