Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PlnP61014 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PlnP61014 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PlnP61014 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PlnP61014 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms