Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bace1P56818 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bace1P56818 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bace1P56818 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bace1P56818 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms