Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp5P56399 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp5P56399 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms