Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2e3P52483 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms