Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms