Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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