Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FanccP50652 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FanccP50652 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FanccP50652 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms