Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbrP50284 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbrP50284 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms