Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tnfsf9P41274 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tnfsf9P41274 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnfsf9P41274 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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