Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VhlP40338 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VhlP40338 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms