Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HexaP29416 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HexaP29416 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HexaP29416 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HexaP29416 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms