Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RxraP28700 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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