Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChgaP26339 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms