Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf239P24399 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms