Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms