Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P0C1Z5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms