Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms