Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms