Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Slc18a3O35304 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Slc18a3O35304 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc18a3O35304 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc18a3O35304 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc18a3O35304 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc18a3O35304 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Slc18a3O35304 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Slc18a3O35304 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Slc18a3O35304 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Slc18a3O35304 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Slc18a3O35304 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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