Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ArxO35085 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ArxO35085 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ArxO35085 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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