Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kif1cO35071 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kif1cO35071 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms