Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Degs1O09005 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms