Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20878L7N244 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms