Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms