Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms