Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20834J3QM72 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm20834J3QM72 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20834J3QM72 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm20834J3QM72 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm20834J3QM72 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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