Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21411J3KMS0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm21411J3KMS0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Gm21411J3KMS0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm21411J3KMS0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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