Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Speer4aF8VPX6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms