Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm28048F7BCN0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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