Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms