Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Syngap1F6SEU4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngap1F6SEU4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms