Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
BC067074F6RXI4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms