Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pdzd2E9Q1M1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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