Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms