Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gimd1E9PW74 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gimd1E9PW74 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms