Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clip3B9EHT4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clip3B9EHT4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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