Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce3B5KM66 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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