Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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