Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms