Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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