Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn3aA2ASI5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scn3aA2ASI5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms