Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc183A2AJB1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc183A2AJB1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms